佐世保国際カントリー倶楽部は風の影響が比較的少ないコースです。プレー時間帯の平均風速は3.1m/sで、強風日（5m/s以上）は年間12%に留まります。

過去3年の気象データでは、佐世保国際カントリー倶楽部の晴れ日（0.1mm/h未満）は年間72%、小雨日（0.1-1mm/h）は19%、雨天日（1mm/h以上）は8%となっています。プレー時間帯の平均降水量は0.25mm/hです。

佐世保国際カントリー倶楽部で快適にラウンドしやすい月は10月です。平均気温21℃・強風日率3%・雨天日率5%と、気温・風・雨のバランスが年間で最も穏やかになる月です。逆に7月は平均気温28.2℃・強風日率18%・雨天日率16%と、気温・風・雨のいずれかが厳しめで対策が必要な月です。